High taxonomic level fingerprint of the human intestinal microbiota by Ligase Detection Reaction - Universal Array approach (Articolo in rivista)

Type

• Articolo in rivista (Classe)
• Prodotto della ricerca (Classe)

Label

• High taxonomic level fingerprint of the human intestinal microbiota by Ligase Detection Reaction - Universal Array approach (Articolo in rivista) (literal)

Anno

• 2010-01-01T00:00:00+01:00 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#doi

• 10.1186/1471-2180-10-116 (literal)

Alternative label

• Marco Candela; Clarissa Consolandi; Marco Severgnini; Elena Biagi; Bianca Castiglioni; Beatrice Vitali; Gianluca De Bellis, Patrizia Brigidi (2010)
  High taxonomic level fingerprint of the human intestinal microbiota by Ligase Detection Reaction - Universal Array approach
  in BMC Microbiology (Online); Biomed Central Ltd., London (Regno Unito)
  (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#autori

• Marco Candela; Clarissa Consolandi; Marco Severgnini; Elena Biagi; Bianca Castiglioni; Beatrice Vitali; Gianluca De Bellis, Patrizia Brigidi (literal)

Pagina inizio

• 116 (literal)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#numeroVolume

• 10 (literal)

Rivista

• BMC Microbiology (Rivista)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#note

• La rivista su cui l'articolo è stato pubblicato ha fattore d'impatto di 2.88 (literal)

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• Pubblicazione scientifica riguardante la messa a punto di un microarray per il monitoraggio del microbiota umano, recentemente associato con malattie quali l’obesità e malattie infiammatorie intestinali. Il microarray sviluppato potrà servire come strumento di indagine anche in campo animale. (literal)

Note

• Scopus (literal)
• ISI Web of Science (WOS) (literal)
• Google Scholar (literal)
• PubMe (literal)

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• Marco Candela, Elena Biagi, Beatrice Vitali, Patrizia Brigidi - DPS, Università di Bologna; Clarissa Consolandi, Marco Severgnini, Gianluca De Bellis - ITB-CNR, Segrate (Mi); Bianca Castiglioni - IBBA-CNR, Milano (literal)

Titolo

• High taxonomic level fingerprint of the human intestinal microbiota by Ligase Detection Reaction - Universal Array approach (literal)

Abstract

• Affecting the core functional microbiome, peculiar high level taxonomic unbalances of the human intestinal microbiota have been recently associated with specific diseases, such as obesity, inflammatory bowel diseases, and intestinal inflammation. In order to specifically monitor microbiota unbalances that impact human physiology, here we develop and validate an original DNA-microarray (HTF-Microbi.Array) for the high taxonomic level fingerprint of the human intestinal microbiota. Based on the Ligase Detection Reaction-Universal Array (LDR-UA) approach, the HTFMicrobi. Array enables specific detection and approximate relative quantification of 16S rRNAs from 30 phylogenetically related groups of the human intestinal microbiota. The HTF-Microbi.Array was used in a pilot study of the faecal microbiota of eight young adults. Cluster analysis revealed the good reproducibility of the high level taxonomic microbiota fingerprint obtained for each of the subject. The HTF-Microbi.Array is a fast and sensitive tool for the high taxonomic level fingerprint of the human intestinal microbiota in terms of presence/absence of the principal groups. Moreover, analysis of the relative fluorescence intensity for each probe pair of our LDR-UA platform can provide estimation of the relative abundance of the microbial target groups within each samples. Focusing the phylogenetic resolution at division, order and cluster levels, the HTF-Microbi.Array is blind with respect to the inter-individual variability at the species level. (literal)

Editore

• Biomed Central Ltd. (Editore)

Prodotto di

• Tecnologie ad Array e di sequenziamento massivo (PM.P06.009.001) (Modulo)
• Conservazione delle risorse genetiche animali e valorizzazione delle loro produzioni (AG.P01.020.001) (Modulo)
• Institute of agricultural biology and biotechnology (IBBA) (Istituto)

Autore CNR

• BIANCA MARIA ELISABETTA CASTIGLIONI (Unità di personale interno)
• GIANLUCA DE BELLIS (Persona)
• MARCO SEVERGNINI (Unità di personale interno)
• CLARISSA CONSOLANDI (Persona)

Insieme di parole chiave

• Keywords of "High taxonomic level fingerprint of the human intestinal microbiota by Ligase Detection Reaction - Universal Array approach" (Insieme di parole chiave)

Incoming links:

Prodotto

• Institute of agricultural biology and biotechnology (IBBA) (Istituto)
• Tecnologie ad Array e di sequenziamento massivo (PM.P06.009.001) (Modulo)
• Conservazione delle risorse genetiche animali e valorizzazione delle loro produzioni (AG.P01.020.001) (Modulo)

Autore CNR di

• CLARISSA CONSOLANDI (Persona)
• BIANCA MARIA ELISABETTA CASTIGLIONI (Unità di personale interno)
• GIANLUCA DE BELLIS (Persona)
• MARCO SEVERGNINI (Unità di personale interno)

Editore di

• Biomed Central Ltd. (Editore)

Http://www.cnr.it/ontology/cnr/pubblicazioni.owl#rivistaDi

• BMC Microbiology (Rivista)

Insieme di parole chiave di

• Keywords of "High taxonomic level fingerprint of the human intestinal microbiota by Ligase Detection Reaction - Universal Array approach" (Insieme di parole chiave)