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SIR2002: the program (Articolo in rivista)

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Burla M.C. 1, Camalli M. 2, Carrozzini B. 2, Cascarano G.L. 2, Giacovazzo C. 2, Polidori G. 1, Spagna R. 2 (2003)
SIR2002: the program
in Journal of applied crystallography
(literal)

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Burla M.C. 1, Camalli M. 2, Carrozzini B. 2, Cascarano G.L. 2, Giacovazzo C. 2, Polidori G. 1, Spagna R. 2 (literal)

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Il programma gira su PC, sistemi operativi Windows 9x/2000/NT/XP e su Workstation (Linux, Unix). Sono utilizzati i compilatori Fortran 90 e C insieme con le librerie grafiche GTK/GDK. Non ci sono limitazioni nel numero di riflessi (indici<512) e il numero massimo di atomi previsti è 3000. Il SIR2002 è distribuito via WEB insieme alle istruzioni per l'installazione, il manuale dell'utente e strutture test. (literal)

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Lo sviluppo di metodi per la determinazione strutturale da cristallo singolo è un progetto di ricerca tradizionale dell'IC. Programmi quali SIR92 e SIR97 hanno largamente contribuito alla soluzione del problema della fase per strutture di piccole e media complessità. Il numero dei loro utilizzatori, basato su un sistema di 'Licence Agreement', supera in larga misura le migliaia di unità in tutto il mondo scientifico. Il programma che qui viene presentato, SIR2002, è disegnato per la determinazione strutturale mediante i metodi diretti sia di strutture medie- piccole sia di strutture macromolecolari a condizione che i dati siano a piu' alta risoluzione di 1.2Å. Il notevole successo che è stato possibile raggiungere nel campo delle strutture macromolecolari è dovuto allo studio teorico di nuovi algoritmi che è stato intrapreso negli anni passati nel nostro istituto. Lo sviluppo di questi algoritmi ha condotto ad affrontare il problema della fase su nuove basi: tecniche di affinamento nello spazio diretto, procedure di modificazione della densità elettronica alternate da affinamenti nello spazio reciproco. Il SIR2002 è stato testato largamente sia presso le sedi degli autori sia da un largo numero di utenti esterni che hanno collaborato come beta-tester. (literal)

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Titolo

Abstract

The structure solution of small molecules is, nowdays, almost a routine process; the ab initio structure solution of macromolecules is, on the country, a challenge for anu crystallographic software. Four programs are well documented: Shake-and-bake (Weeks et al.,1994), SHELX-D (Sheldrick, 1998), ACORN (Foadi et al., 2000) and SIR2000-N (Burla el al.,2001). A new direct-methods program, SIR2002 (Burla et al.,2002), has been designed to solve both small and large crystal structures. (literal)

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